Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms