Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms