Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms