Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms