Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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