Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRRTQ9BXP5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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