Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms