Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms