Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PITX2Q99697 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms