Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms