Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms