Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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