Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms