Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ZNF248Q8NDW4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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