Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD1Q8N815 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms