Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LLGL2Q6P1M3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms