Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms