Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms