Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF827Q17R98 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms