Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFKFB4Q16877 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms