Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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