Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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