Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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