Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PTCH1Q13635 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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