Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPN13Q12923 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPN13Q12923 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPN13Q12923 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPN13Q12923 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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