Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYCNQ0VAF6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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