Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms