Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALD1Q05682 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms