Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms