Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms