Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms