Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms