Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms