Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEP78395 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms