Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP1S1P61966 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms