Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL23P55773 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL23P55773 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms