Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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