Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA4P51532 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA4P51532 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms