Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms