Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NMUP48645 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NMUP48645 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NMUP48645 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms