Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD4P46934 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms