Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSFMP43897 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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