Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP2P42575 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP2P42575 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms