Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms