Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM5AP29375 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDM5AP29375 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM5AP29375 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDM5AP29375 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms