Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLD1P28340 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms