Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms