Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RARBP10826 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RARBP10826 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RARBP10826 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms