Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GLI1P08151 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI1P08151 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI1P08151 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI1P08151 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms