Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTMAP06454 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTMAP06454 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTMAP06454 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms